京师范大学联合申报组建“水沙科学教育部重点实验室”获得批准。
　　2000年8月，武汉大学，武汉水利电力大学，武汉测绘科技大学，湖北医科大学合并，组成新的武汉大学。
　　2000年9月，该院主持召开了“黄河节水”国际会议。
　　2000年10月，郭生练教授任湖北省科技厅副厅长。
　　2001年1月，学校宣布新武汉大学院系调整结果及各院领导班子。水利水电学院行政班子是：院长谈广鸣，副院长方坤河、赵英林、黄介生、杨建东、李美华 。
　　2000年12月，武汉大学水利水电学院成立。
　　2001年12月，系统工程学科获得博士学位授予权。
　　2001年1月，水利水电学院召开第一次党政联席会议，提出了“教学上质量，科研上水平，师资上层次，学科创一流”的工作目标。
　　2001年1月，水利水电学院成立四个系：水力发电工程系、水利工程系、河流工程系、水文水资源系。设置的本科专业有：农业水利工程、水利水电工程、港 口海岸及治河工程、水文与水资源工程。
　　2001年3月，水利水电学院党委成立，书记伍祥富，副书记程连珍、俞兆旺，委员有谈广鸣、方坤河、赵英林、罗金耀、龚国芝、吴运卿。
　　2001年3月，学院主持召开了“国际水稻节水灌溉”国际会议。
　　2001年6月，农田水利工程、流域开发与河流工程、水工结构工程等三个九五“211”工程重点学科建设项目通过专家验收。
　　2001年9月，张仁铎（美籍华人）为农业水利工程专业特聘教授。
　　2001年11月，完成了实验室人员定编定岗工作，成立了院基础教学实验中心、水工结构实验中心、水工模型实验中心、水文水资源实验中心。
　　2001年12月，水利水电工程、水文学及水资源被评为国家重点学科。
　　2001年12月，举办了黄河节水策略国际研讨会。
　　2002年3月，成立水资源与水电工程湖北省重点实验室。
　　2002年4月，成立国家节水灌溉北京工程技术研究中心武汉大学试验研究基地。
　　2002年10月，院举行设置《城市水务》本科专业专家论证会，上海市水务局 、深圳市水务局、武汉市水务局、清华大学、西安理工大学等单位的专家出席了 论证会，一致认为设置城市水务专业是十分必要的，也是切实可行的，应尽快实 施。
　　2002年10月，“水资源与水利水电工程”重点学科建设项目获十五“211”工程建设立项。
　　2002年11月3日，水利水电学院隆重举行“成立五十周年”庆典。水利部、国家电力公司等部门领导人出席庆典活动。