野山国家级自然保护区
　　9.梅花山国家级自然保护区
　　10.戴云山国家级自然保护区
　　11.闽江源国家级自然保护区
　　12.君子峰国家级自然保护区
　　广东 (11)
　　1.南岭国家级自然保护区
　　2.车八岭国家级自然保护区
　　3.丹霞山国家级自然保护区
　　4.内伶仃岛——福田国家级自然保护区
　　5.珠江口中华白海豚国家级自然保护区
　　6.湛江红树林国家级自然保护区
　　7.鼎湖山国家级自然保护区
　　8.像头山国家级自然保护区
　　9.惠东港口海龟国家级自然保护区
　　10.徐闻珊瑚礁国家级自然保护区
　　11.雷州珍稀水生动物国家级自然保护区
　　广西 (15)
　　1.大明山国家级自然保护区
　　2.花坪国家级自然保护区
　　3.猫儿山国家级自然保护区
　　4.山口红树林生态国家级自然保护区
　　5.合浦营盘港——英罗港儒艮国家级自然保护区
　　6.北仑河口国家级自然保护区
　　7.防城金花茶国家级自然保护区
　　8.十万大山国家级自然保护区
　　9.弄岗国家级自然保护区
　　10.大瑶山国家级自然保护区
　　11.木论国家级自然保护区
　　12.千家洞国家级自然保护区
　　13.岑王老山国家级自然保护区
　　14.九万山国家级自然保护区
　　15.金钟山黑颈长尾雉国家级自然保护区
　　海南 (9)
　　1.三亚珊瑚礁国家级自然保护区
　　2.东寨港国家级自然保护区
　　3.铜鼓岭国家级自然保护区
　　4.大洲岛海洋生态国家级自然保护区
　　5.大田国家级自然保护区
　　6.尖峰岭国家级自然保护区
　　7.五指山国家级自然保护区
　　8.坝王岭国家级自然保护区
　　9.吊罗山国家级自然保护区
　　西南地区
　　贵州 (9)
　　1.习水中亚热带常绿阔叶林国家级自然保护区
　　2.赤水桫椤国家级自然保护区
　　3.梵净山国家级自然保护区
　　4.麻阳河国家级自然保护区
　　5.长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
　　6.草海国家级自然保护区
　　7.雷公山国家级自然保护区
　　8.茂兰国家级自然保护区
　　9.宽阔水国家级自然保护区
　　云南 (17)
　　1.哀牢山国家级自然保护区
　　2.高黎贡山国家级自然保护区
　　3.大山包黑颈鹤国家级自然保护区
　　4.大围山国家级自然保护区
　　5.金平分水岭国家级自然保护区
　　6.黄连山国家级自然保护区
　　7.文山国家级自然保护区
　　8.无量山国家级自然保护区
　　9.西双版纳国家级自然保护区
　　10.西双版纳纳版河流域国家级自然保护区
　　11.苍山洱海国家级自然保护区
　　12.白马雪山国家级自然保护区
　　13.南滚河国家级自然保护区
　　14.长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
　　15.药山国家级自然保护区
　　16.会泽黑颈鹤国家级自然保护区
　　17.永德大雪山国家级自然保护区
　　青海 (5)
　　1.循化孟达国家级自然保护区
　　2.青海湖国家级自然保护区
　　3.可可西里国家级自然保护区
　　4.隆宝国家级自然保护区
　　5.三江源国家级自然保护区
　　西藏 (9)
　　1.雅鲁藏布江中游河谷黑颈鹤国家级自然保护区
　　2.芒康滇金丝猴国家级自然保护区
　　3.珠穆朗玛峰国家级自然保护区
　　4.色林错国家级自然保护区
　　5.羌塘国家级自然保护区
　　6.雅鲁藏布大峡谷国家级自然保护区
　　7.察隅慈巴沟国家级自然保护区
　　8.拉鲁湿地国家级自然保护区
　　9.类乌齐马鹿国家级自然保护区
　　西北地区
　　甘肃 (13)
　　1.兴隆山国家级自然保护区
　　2.祁连山国家级自然保护区
　　3.敦煌西湖国家级自然保护区
　　4.安西极旱荒漠国家级自然保护区
　　5.民勤连古城国家级自然保护区
　　6.白水江国家级自然保护区
　　7.莲花山国家级自然保护区
　　8.尕海——则岔国家级自然保护区
　　9.太统——崆峒山国家级自然保护区
　　10.连城国家级自然保护区
　　11.小陇山国家级自然保护区
　　12.盐池湾国家级自然保护区
　　13.安南坝野骆驼国家级自然保护区
　　宁夏 (6)
　　1.贺兰山国家级自然保护区
　　2.沙坡头国家级自然保护区
　　3.罗山国家级自然保护区
　　4.灵武白芨滩国家级自然保护区
　　5.六盘山国家级自然保护区
　　6.哈巴湖国家级自然保护区
　　内蒙古 (23)
　　1.赛罕乌拉国家级自然保护区
　　2.达里诺尔国家级自然保护区
　　3.白音熬包国家级自然保护区
　　4.黑里河国家级自然保护区
　　5.大黑山国家级自然保护区
　　6.大兴安岭汗马国家级自然保护区
　　7.红花尔基樟子松林国家级自然保护区
　　8.辉河国家级自然保护区
　　9.达赉湖国家级自然保护区
　　10.科尔沁国家级自然保护区
　　11.图牧吉国家级自然保护区
　　12.大青沟国家级自然保护区
　　13.锡林郭勒草原国家级自然保护区
　　14.鄂尔多斯遗鸥国家级自然保护区
　　15.西鄂尔多斯国家级自然保护区
　　16.乌拉特梭梭林——蒙古野驴国家级自然保护区
　　17.贺兰山国家级自然保护区
　　18.额济纳胡杨林国家级自然保护区
　　19.阿鲁科尔沁草原国家级自然保护区
　　20.哈腾套海国家级自然保护区
　　21.额尔古纳国家级自然保护区
　　22.鄂托克恐龙遗迹化石国家级自然保护区
　　23.大青山国家级自然保护区
　　新疆 (9)
　　1.阿尔金山国家级自然保护区
　　2.罗布泊野骆驼国家级自然保护区
　　3.巴音布鲁克国家级自然保护区
　　4.托木尔峰国家级自然保护区
　　5.西天山国家级自然保护区
　　6.甘家湖梭梭林国家级自然保护区
　　7.哈纳斯国家级自然保护区
　　8.塔里木胡杨国家级自然保护区
　　9.艾比湖湿地国家级自然保护区
　　注：标“*”者，为跨省(区、市)国家级自然保护区。