。张炜炜同学参加第十八届福建省青少年科技创新大赛获三等奖。学校被厦门市城管办评为“厦门市园林绿化考评先进单位”。
　　2004年，学校再次被评为市级文明单位和市级文明学校。学校顺利通过省级“双高普九”的评估。7月，召开校八届五次教代会，审议通过《厦门第二中学教师诚信育人十项承诺》和《厦门第二中学岗位津贴分配办法》。校足球队参加U18福建省中学生足球赛夺得冠军。曾赐维同学参加“孔子杯”全国中学生“关爱生命”作文大赛获高中组一等奖。阮可舒同学参加2004年全国初中化学素质与实验能力竞赛获得福建省三等奖。黄舒珊同学参加第七届“语文报杯”作文大赛获福建省三等奖。吴晓鸿、林少斌两位同学参加第3届福建省青少年电脑机器人竞赛获三等奖。

　　2005年，校足球队参加省足球传统校足球比赛夺得冠军，在市中学生足球赛上派出U15队参赛，夺得亚军。召开校九届一次教代会，审议通过《厦门第二中学绩效考核奖励分配试行办法》。校学生合唱队参加直属中学合唱比赛荣获三等奖。杨佳琳、叶雪红两位同学的雕塑作品《随风》参加福建省第六届少儿美术大赛获得银奖。黄少阳、谢昊两位同学参加第四届福建省青少年机器人竞赛，获得创意设计和工程设计两项三等奖；张梦洋，张智敏两位同学获机器人竞赛营救项目的三等奖。陈文婕同学光荣加入中国共产党。
　　2006年3月，学校被授予厦门市首批“平安校园”称号。9月，林解成校长离任，苏伯群副校长主持行政工作。11月，学校被厦门市委，市政府授予参加省第十三届运动会先进集体。12月，召开九届二次校教代会，审议通过《厦门二中创建文明学校暨素质教育督导评估自评结论》，《厦门第二中学绩效奖励分配办法》。学校舞蹈队编排的舞蹈《如火的青春》参加厦门市第三届群众文化艺术节暨厦门市第十六届中小学生艺术节直属中学舞蹈、曲艺、小品专场比赛、荣获二等奖。
　　2007年1月，谢志强任校长，苏伯群副校长调任双十中学副校长。我校合唱队在2007年厦门市中学生合唱比赛中荣获二等奖；在2007年厦门市中小学生绘画摄影雕塑展中，陈子怡、陈琳同学的摄影作品分别获中学组二、三等奖；叶艺玲同学的雕塑作品荣获中学组三等奖；邱璐瑶同学在市中学生演讲比赛中荣获三等奖。9月，80届校友赵立平先生为支持母校办学，以其母亲名讳设立“厦门二中林维筠校友奖教奖学专项奖金”，该专项奖金为期10年（2007-2016年，每年人民币8万元）。