科研究所 National Eye Institute，NEI 1968
　　国立人类基因组研究所 National Human Genome Research Institute，NHGRI 1990
　　国立药物滥用研究所 National Institute on Drug Abuse，NIDA 1974
　　国立老化研究所 National Institute on Aging，NIA 1974
　　国立环境卫生研究所 National Institute of Environmental Health Sciences，
　　NⅢHS 1966
　　国立酒精滥用与中毒研究所 National Institute on Alcohol Abuse and Alcoholism，NIAAA 1970
　　国立综合医学研究所 National Institute of General Medical Sciences，NIGMS 1963
　　国立变态反应与感染性疾病研究所 National Institute of Allergy and Infectious Diseases，NIAID l948
　　国立精神卫生研究所 National Institute of Mental Health．NIMH 1946
　　国立关节肌肉骨骼及皮肤病研究所 National Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases，NIAMS 1986
　　国立神经病学与中风研究所 National Institute of Neurological Disorders and Stroke．NINDS 1950
　　国立儿童健康与人类发育研究所 National Institute of Child Health and Human Development，NICHD 1963
　　国立护理医学研究所 National Institute of Nursing Research．NINR 1986
　　国立耳聋与其他交流障碍性疾病研究所 National Institute on Deafness and Other Communication Disorders．NIDCD 1988
　　国立医学图书馆 National Library of Medicine，NLM 1968年归属NIH
　　国立口腔与颅面研究所 National Institute of Dental and Craniofacial Research．NIDCR 1948
　　国立研究资源中心 National Center for Research Resources．NCRR 1956
　　John E．Fogarty
　　国际中心 John E．Fogarty International Center．FIC 1968
　　国立糖尿病消化与肾病研究所 National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases．NIDDK 1950
　　国立补充与替代医学研究中心 ，National Center for Complementary
　　an d Alternative Medicine，NCCAM l993
　　国立生物医学影像学与生物工程学研究所 National Institute for Biomedical Imaging and Bioengineering，NIBIB 200O
　　临床医学中心 Warren Grant Magnuson Clinical Center．CC 1953
　　信息技术中心 Center for Information Technology．CIT l964
　　国立少数民族健康与健康水平差别研究中心 National Center for Minority Health and Health Disparities，NCMHD 1990
　　另外，院长尚直接领导多个部门，负责NIH的行政管理工作：
　　院外研究处(the Office of Extramural Research，OER)、
　　院内研究处(the Office of Intramural Research，OIR)、
　　行政管理处(the Office of Administration，OA)、
　　艾滋病研究处(the Office of AIDS Research，OAR)、
　　行为与社会科学研究处(the Office of Behavioral and Social Sciences Research，OBSSR)、
　　通信与公共关系处(the Office of Communications and Public Liaison，OCPL)、社区联络处(the Office of CommUnity Liaison，OCL)、
　　疾病预防处(the Office of Disease Prevention，ODP)、
　　教育处(the Office of Education，OE)、
　　机会均等处(the Office of Equal OpportUnity，OEO)、
　　财务管理处(the Office of Financial Management，OFM)、
　　人力资源管理处(the Office of Human Resource Management，OHRM)、
　　妇女健康研究处(the Office of Research on Women’S Health，ORWH1、
　　研究服务处(the Office of Research Services，ORS1、
　　科学政策处(the Office of Science Policy．OSP)、
　　立法政策与分析处(the Office of Leg．isolative Policy and Analysis，OLPA)及技术转让处(the Office of Technology Transfer．OTT) 。
　　NIH的现任院长是Elias A．Zerhouni博士，生于1951年4月，1968—1975年在阿尔及尔(Algiers)大学医学院学习， 获医学博士学位，2002年5月20日任现职，是NIH历史上的第十五位院长。此前他曾任约翰斯•霍普金斯(Johns Hopkins)大学医学院的执行(常务)副校长，Russell H．Morgan放射学系和放射学协会主席，Martin Donner的放射学和生物医学工程教授。在影像学研究领域他成绩斐
　　然，对CAT(computerized axial tomography，