副书记。洪海征等同学分获全国知识竞赛前三名。郑川同学获省三好学生称号，薛初晴同学获省优秀学生干部称号。　1994年7月，学校被评为省教育工会先进集体。厦门市市级文明学校和花园式单位称号。殷秀明老师获特级教师称号。郁廷同学获首届“黄河杯”中国书画大赛三等奖。陈颖坚同学获全国初中应用物理知识竞赛三等奖。　1995年12月，沈俊仪副校长主持学校行政工作。学校被指定为全省唯一的英语SEFC新教材试点。李屿芬老师荣获全国优秀教师光荣称号。被授予国家级考试规范考点称号。潘潇潇同学获全国初中应用物理知识竞赛（厦门赛区）一等奖。洪海征、魏征同学分获省第四届中学生生物竞赛选拔赛二、三等奖。魏征同学获全国初中学生奥林匹克化学比竞赛（福建赛区）三等奖。　1996年5月，厦门二中通过福建普通完中二级达标学校验收。5月19日，校友会召开全体理事会，选举产生了第四届理事会，傅孙颐任理事长。6月，赖菡任党总支书记。8月，福建省重点体育传统项目学校足球赛在霞浦举行，我校足球队获四连冠。8月，我校应届高中毕业生黄玲毅同学高考成绩荣获我市文科（含外语类）总分第一名、福建省第三名。魏微同学荣获我市文科总分第二名、福建省第四名。洪海征同学获我市高考理科总分第十四名。8月18日，厦门二中“老三届”同学会成立。9月，我校开办初中体育班，以培养厦门足球、航海运动的后备人才。　1997年2月10日，举行筹备一九九八年校庆联席会议。成立校庆办会室，沈俊仪为主任。7月，女兵方队参加厦门市庆祝建军70周年阅兵式，荣获第二名。11月，汪金煌任党总支副书记。12月1日至3日，厦门英华中学一九四七届华晋社隆重举行成立五十周年纪念活动。旅菲校友陈并茂、鲁恢文等赞助捐建的“英华华晋楼”举行落成典礼。被授予厦门市双拥先进单位称号。李屿芬老师荣获省劳动模范。　1998年1月10日，校领导和校友会共商百年校庆事宜。讨论通过以卢嘉锡校友为名誉主任、蔡望怀校友为主任的筹备委员会组成人员名单。荣获1995—1997年度市优秀教师称号。朱丹老师获厦门市区县级教坛新秀称号。5月，殷承宗校友由美来厦，为母校百年华诞举行义演。8月。我校足球队在省体育传统项目学校足球赛中荣获“六连冠”、市中学生足球赛“十二连冠”。10月，获初中效益均值优秀奖。　11月28日上午，3000余名来自海内外的校友，1400余名师生云集学校大操场，参加厦门二中(英华书院建校100周年，毓德女学建校128周年)庆祝大会。大会结束后，还举行了厦门二中体育馆奠基仪式和校园计算机网络开通仪式。校庆期间，校友们纷纷解囊，捐资助母校发展教育,吴丽英校友捐资60万元用于兴建学校艺术楼；周宗典校友为“周永渊奖学金”注资10万元港币；殷承宗校友将义演所得72000元人民币捐出用于校庆；蔡望怀校友为校庆募集资金20万元。百年校庆共收得礼品礼金约合人民币162万元。校庆期间还举办了苏钟文校友体育集邮展，汪易扬校友书画展，足球邀请赛，女篮邀请赛，科普讲座等丰富多彩的活动。12月,教工宿舍(集资房,鼓新路37号之四、之五、之六)三栋楼竣工，总建筑面积为2120平方米。　1999年2月，沈俊仪调任厦门市松柏中学校长，林解成任校长。学校被授予全国体育卫生先进单位称号，荣获1998～1999年度厦门市文明学校、厦门市1999年初中教学质量优秀奖。　2000年1月，汪金煌任党总支书记。5月召开八届一次教代会，审议通过《厦门二中校内工资分配方案》学校荣获福建省高中会考先进单位，福建省1996～2000年青少年体育工作先进学校，厦门市1999～2000学年学校艺术教育先进单位，厦门市中学生田径运动会团体总分第六名。校足球队再次夺得省赛、市赛冠军，并代表厦门市参加全国U18足球赛获得第七名。曾圣洁同学的小发明《球类训练器》获省市青少年科技发明奖，并取得国家专利局颁发的专利证书。李江同学参加“可口可乐”杯奥运先锋选拔赛，在一万多名竞争者中脱颖而出，争得了全国只有三名赴悉尼观摩奥运会的资格。朱哓芳、赖春华两位同学光荣地加入中国共产党。　2001年被评为全国群众体育工作先进单位、厦门市文明单位、厦门市社会治安综合治理先进集体、福建省第一批省级花园式单位、福建省党政工共建先进教工之家、1996～2001年厦门市学校体育工作先进单位。10月召开八届二次教代会，审议通过《厦门第二中学2001～2005年发展规划》、《厦门第二中校务公开工作制度》。11月被厦门市教育委员会确立为国家课程改革厦门实验区中学美术学科基地校。　2002年6月，学校体育馆竣工，总建筑面积为2419平方米。8月，厦门二中团委获厦门市“五四红旗团委”。12月，召开校八届三次教代会，审议通过了《厦门二中首席教师评选制度》，《厦门二中骨干教师评选制度》、《厦门二中青年教师培养制度》和《厦门二中先进教育者、先进德育工作者评选工作补充规定》。　2003年4月，200米塑胶跑道和面积为5682平方米的运动场人工草皮建成完工。7月，校足球队参加厦门市中学生足球赛获得U15，U18双冠军。8月，校足球队参加福建省传统足球比赛再次夺魁。9月，获厦门市2003届初中教学质量进步奖。10月，召开校八届四次教代会，审议通过《厦门二中贯彻〈厦门市教育系统聘任制暂行规定〉实施方案》。苏娴、毛雨两位同学参加“健身杯”全国中学生通讯作文比赛获一等奖。陈璇同学参加2003年全国中学生英语作文大赛获初三年组二等奖。张炜炜同学参加第十八届福建省青少年科技创新大赛获三等奖。学校被厦门市城管办评为“厦门市园林绿化考评先进单位”。　2004年，学校再次被评为市级文明单位和市级文明学校。学校顺利通过省级“双高普九”的评估。7月，召开校八届五次教代会，审议通过《厦门第二中学教师诚信育人十项承诺》和《厦门第二中学岗位津贴分配办法》。校足球队参加U18福建省中学生足球赛夺得冠军。曾赐维同学参加“孔子杯”全国中学生“关爱生命”作文大赛获高中组一等奖。阮可舒同学参加2004年全国初中化学素质与实验能力竞赛获得福建省三等奖。黄舒珊同学参加第七届“语文报杯”作文大赛获福建省三等奖。吴晓鸿、林少斌两位同学参加第3届福建省青少年电脑机器人竞赛获三等奖。　2005年，校足球队参加省足球传统校足球比赛夺得冠军，在市中学生足球赛上派出U15队参赛，夺得亚军。召开校九届一次教代会，审议通过《厦门第二中学绩效考核奖励分配试行办法》。校学生合唱队参加直属中学合唱比赛荣获三等奖。杨佳琳、叶雪红两位同学的雕塑作品《随风》参加福建省第六届少儿美术大赛获得银奖。黄少阳、谢昊两位同学参加第四届福建省青少年机器人竞赛，获得创意设计和工程设计两项三等奖；张梦洋，张智敏两位同学获机器人竞赛营救项目的三等奖。陈文婕同学光荣加入中国共产党。　2006年3月，学校被授予厦门市首批“平安校园”称号。9月，林解成校长离任，苏伯群副校长主持行政工作。11月，学校被厦门市委，市政府授予参加省第十三届运动会先进集体。12月，召开九届二次校教代会，审议通过《厦门二中创建文明学校暨素质教育督导评估自评结论》，《厦门第二中学绩效奖励分配办法》。学校舞蹈队编排的舞蹈《如火的青春》参加厦门市第三届群众文化艺术节暨厦门市第十六届中小学生艺术节直属中学舞蹈、曲艺、小品专场比赛、荣获二等奖。　2007年1月，谢志强任校长，苏伯群副校长调任双十中学副校长。我校合唱队在2007年厦门市中学生合唱比赛中荣获二等奖；在2007年厦门市中小学生绘画摄影雕塑展中，陈子怡、陈琳同学的摄影作品分别获中学组二、三等奖；叶艺玲同学的雕塑作品荣获中学组三等奖；邱璐瑶同学在市中学生演讲比赛中荣获三等奖。9月，80届校友赵立平先生为支持母校办学，以其母亲名讳设立“厦门二中林维筠校友奖教奖学专项奖金”，该专项奖金为期10年（2007-2016年，每年人民币8万元）。