南京药学院院长、党委书记
　　汪青辰
　　1959.9--1964.9
　　南京药学院院长、党委书记
　　李昌文
　　1964.9--1973.5
　　南京药学院党委书记
　　王心田
　　1978.12--1979.3
　　南京药学院党委书记
　　1973.2--1978.12
　　革命委员会主任
　　王钧彦
　　1978.12--1983.11
　　南京药学院院长
　　张克威
　　1979.3--1983.11
　　南京药学院党委书记
　　尹宗靖
　　1983.11--1986.10
　　南京药学院院长
　　1986.10--1988.10
　　中国药科大学校长
　　1988.10--1991.12
　　中国药科大学党委书记
　　徐群
　　1983.11--1986.10
　　南京药学院党委书记
　　1988.10--1997.6
　　中国药科大学校长
　　1991.12--1995.3
　　中国药科大学党委书记
　　李干生
　　1995.3--1997.6
　　中国药科大学党委书记
　　吴晓明
　　1997.6--至今
　　中国药科大学校长
　　1997.6--2001.11
　　中国药科大学党委副书记（主持党委工作）
　　胡金波
　　2001.11--2008.4
　　中国药科大学党委书记
　　刘贵友
　　2008.4--至今
　　中国药科大学党委书记

公司

　　1993年，成立了中国药科大学科技实业（集团）总公司，下属中国药科大学制药有限公司、中国药科大学生物制药有限公司、中国药科大学医药化工研究所、中国药科大学神农生物技术公司和中国药科大学医药有限公司。公司主要生产和销售各类药物，特别是学校自主研制的药物。

学校层次

　　教育部于2008年4月启动了一级学科评估，中国药科大学一级学科药学、中药学在此次参评高校中，药学排名第一，中药学排名第三。