岩溶、冰芯、湖泊、古海洋学和人类活动对陆地生态系统影响以及海洋生态动力学等方面开展古环境变化和过程研究，重建了东亚自然环境演化规律；积极而卓有成效地推动了全球变化研究。陆相生油理论、层控矿床地球化学、东亚大气环流和东亚季风环境污染机理、青藏高原隆升及环境效应等研究工作，取得了理论上的重大突破。根据地域分异、地表水热平衡、元素迁移转化和生态环境特征，完成了各种自然区划、生态环境区划、农业和经济区划，在国民经济建设中得到了广泛的应用。在沙漠化防治、水土流失治理、中低产田改造、退化生态系统恢复与重建、环境污染控制和海水养殖、海洋药物等方面，提供了一批实用的技术和模式。遥感技术、地理信息系统技术、全球定位系统技术所取得的研究成果和信息基础设施的建设，使地球信息科学在政府决策和科技、经济、社会发展中发挥更为重要的作用。
　　高技术研究与发展
　　在高技术研究与发展领域，中国科学院共有28个研究所、2个技术支撑单位、1个国家实验室、43个国家重点实验室和院重点实验室，14600余名科研技术人员。主要工作涉及信息技术、先进制造、光电科技、材料、能源、交通、化学工程和空间科学技术等领域，曾为我国计算机、激光、合成橡胶、“两弹一星”等研究做出过重大贡献。近几年来，在高技术研究与发展领域进一步加强了基础性研究和高技术前沿探索，不断增强自主创新能力。同时，为了强化研究所的科技成果转化能力和工业配套能力，已建成31个国家工程中心和院工程中心，并按现代企业制度管理，形成一个高技术企业群体。
　　中国科学院高技术研究与发展工作的任务是：从事关系到我国经济发展、国防建设与社会进步的基础性、战略性、前瞻性高新技术研究；承担国家重大项目中的关键技术研究开发工作，解决国家急需的重大科技问题；提高我国高技术自主创新能力，不断促进高技术产业发展。在提高我国高技术的国际竞争能力、促进我国高技术产业发展、解决我国经济发展、国防建设和社会可持续发展中的重大科学技术问题等方面，起到有显示度的和不可替代的作用。
　　各研究所积极承担国家重点基础研究计划、国家高技术研究发展计划、国家重点科技攻关计划等国家重大科技任务，加强与企业的合作，取得了一系列重大成果。工业机器人产业化、实践五号科学实验卫星和风云系列气象卫星的有效载荷、小型化超强超短激光、纳米材料、有机合成化学、40万千瓦蒸发冷却电机曙光3000超级服务器、“龙芯”高性能CPU芯片等大批创新研究成果，为我国信息技术和自动化、化工与材料、能源等领域的科技发展写下了新的篇章。
　　高技术产业化
　　在高技术产业化方面，中国科学院按照新时期办院方针，坚持面向国家战略需求，加强关键技术创新与集成，加强科技创新成果的转化，为我国产业结构调整、保持经济快速增长以及社会可持续发展做出了直接贡献。同时，积极建立高技术产业发展平台，进一步促进科技成果转化的市场化、社会化和企业化，进一步促进高技术产业的发展。
　　资兴办的企业，分布在11个行业，其中已经认定的高新技术企业有219家。院直接投资的企业（含首批转制单位）有82家，如著名的联想集团控股公司等；研究所投资的企业有356家，如在科技成果转化方面表现突出的成都地奥制药集团有限公司、上海中科合臣化学公司等。目前，全院已有8家院、所投资的公司在境内外上市。在31个国家和院级工程研究中心中，有14个已经完成公司制改造。此外，在建和筹建中的科技产业园区有21个。
　　中国科学院依法设立了“中国科学院国有资产经营公司”，代表院对院直接投资的全资、控股、参股企业行使出资人权利，并对经营性国有资产承担相应的保值增值责任。
　　2001年度，院、所投资企业营业收入434.54亿元；利税总额42.99亿元；创汇额2.94亿美元；所有者权益117.22亿元；从业人员约5.24万人，其中为社会提供的就业机会超过4万人。
　　中国科学院积极推进科技与经济的有效结合，十分重视与省市的技术经济合作，近年来陆续与23个省、市、自治区及有关地（市）签署了全面合作协议。同时，多渠道、多途径、多层面地推进与产业部门以及大中型企业的合作，在烟草、纺织、石化、机电等行业加强技术合作，并与中国海洋石油公司、大庆油田、上海电机集团、上海广电集团等大型企业集团建立了长期合作关系。中国科学院与国家经贸委、教育部共同组织实施了“产学研联合开发工程”，与3000多家企业建立了多种合作关系。为加强与地方、行业、企业的合作，向全国29个省（市）的170个地（市）、县和一批企业选派了科技副职，同时接收地方和企业选派的挂职干部在院短期工作。
　　据不完全统计，院与地方合作项目在2001年度为地方形成销售收入152亿元人民币,利税33亿元人民币。另外，创造社会效益折合114亿元人民币。
　　队伍建设与人才培养
　　中国科学院拥有一支高水平的科技人才队伍，现有中国科学院院士256人，占中国科学院院士总数的39.8%；中国工程院院士53人，占中国工程院院士总数的8.6%。全院有专业技术人员3.7万人,其中高级专业技术人员1.4万人、中级专业技术人员1.4万人，初级专业技术人员0.75万人。全院在读研究生2万余人，在站博士后1千余人。
　　20世纪50年代，一大批海内外优秀人才聚集在中国科学院，为“两弹一星”的研制做出了历史性贡献。80年代开始，为培育中青年科技骨干，解决人才断层问题，中国科学院在国内率先推出了一系列新举措。90年代初推出了“百人计划”，以吸引和培养优秀学科带头人，全院人才队伍结构得到调整和优化。实施知识创新工程试点工作以来，在全院推行了以队伍结构优化为核心的人员总量控制、建立与国际接轨的新型用人制度和“三元”结构分配制度等人事制度改革，为中国科学院的改革与发展奠定了良好的基础。1999年和2001年分别启动了“引进国外杰出人才计划” 与“海外知名学者计划”，加大了对国外优秀青年学者的吸引力度。目前，全院知识创新工程的科技岗位中，45岁以下科技人员已占科技人员总数的75%以上，全院人才队伍呈现出人员精干、结构合理、创新能力不断提高，国际、国内地位不断提升的良好态势。
　　为保持人才队伍的创新活力和竞争能力，中国科学院自1978年开始选派优秀的科技人员和管理骨干出国深造，迄今已公派1.6万名访问学者、研究生到40多个国家和地区留学和访问进修，目前已有近1万余人学成回国工作。同时，在院内初步形成了以中国科学院管理干部学院为龙头，以京外若干基地为依托的继续教育网络。
　　为国家培养和输送高层次科技人才，是中国科学院对国家和社会的一个重要贡献。中国科学院于1951年与高校一起开始实行统一计划招收研究生制度，1977年率先恢复因“文革”而中断的研究生招生，1978年经党中央批准成立了我国第一个研究生院——中国科技大学研究生院。50年来，中国科学院为国家培养和输送了7万余名研究生，其中包括中国第一位理学博士、第一位工学博士、第一位女博士和第一位双学位博士。2001年，经教育部和国务院学位委员会批准，中国科学院研究生院正式成立，现有授予博士学位的学科专业基本覆盖了理科所有的学科领域，同时还具有相当数量的工程技术学科和一定数量的人文学科的博士学位授予点，全院形成了一个以北京为主体、联系和覆盖全院的研究生教育网络。
　　中国科学技术大学是中国科学院于1958年创办、以前沿科学和高新技术为主、兼有以科技为背景的管理和人文学科的综合性全国重点大学。建校40多年来，共为国家培养了近5万名高层次人才。中国科技大学也是首批获准进入国家“211工程”建设和国家重点建设世界知名的高水平大学之一。
　　国际合作与交流
　　中国科学院将国际科技合作作为促进现