一、地理位置

　　保护区位于新疆维吾尔自治区塔古克自治县境内，地处天山、昆仑山、喀刺昆仑山、喜马拉雅山和兴都库什山交汇而成的山结的东帕米尔高原上。生物地理分区属2.23.8和 I(II)2(2)或 I(III)3(2)成它们的过渡地带。面积1500000公顷。其地理位置在东经74°30’-77°00’，北纬36°38’-37°30’之间。

二、自然概况

　　保护区属高山山区，海拔平均在4000米以上。海拔8611米的世界第二高峰— 乔戈里峰屹立于保护区的南向。高原6000米以上终年积雪的高峰构成一片银白世界，塔什库尔干高原野生动物保护区就在这冰峰雪岭的环境之中，帕米尔在造山运动中和青藏高原一起隆起，由前震旦、石炭、二叠、依罗系等变质沉积岩和前寒武纪、华西力期花岗岩组成。由于强烈切割作用，高原上高山谷地相对高差多在1000—2000米之间。高山冰雪及冰冻风化作用强烈，以冰斗和冰斗山谷冰川为多。在海拔4300米以上的河谷中，U形谷及泥石流阶地非常发育。海拔3100米年均温3℃，无霜期70天；年降水量63毫米，以固态降水为主，永久雪线高度阴坡为4600—4700米，阳坡为4800一5000米。土壤类型主要有高山草甸土、高山草甸草原土和高山荒漠土。河谷中有革甸土和草甸沼泽土，海拔3000米左右的河谷中，则发育了泥炭沼泽土，由于高原上外琶力侵蚀作用、土层根菠、多砾石、有机质含量较低。帕米尔是印度河，阿姆河及塔里木河上游叶尔芜河的发源地。塔什库尔干县境的红其拉甫河、明铁盖河交汇而成的塔什库尔干河和马尔详的普备西都河均向东北汇入叶尔羌河，冰山及冰雪融水为主要补给水源。在宽阔的河谷中，裂隙水及泉水出露形成许多大小不等的湖泊和沼泽。

三、动物资源

　　保护区内兽类种类虽不多，但不少是珍稀镣危物种。动物地理分区屑IVA。分布在马尔洋、红其拉甫附近高山地区的雪豹，为国家一级保护的野生动物。分布在西南部的托克满苏、明扶盖和南部的红其拉甫有北山羊、盘羊和岩羊以及旱獭。前者属国家一级保护动物，后几种属二级保护动物。东部的马尔洋，上述珍稀濒危羊类成群分布，每群10—70只不等，在托克满苏甚至可见百只以上大群盘羊活动。中、巴边界这一带雪豹、盘羊等珍稀动物的保护，受到世界有关组织和人士的极大重视。边界两侧保护区的建立即是在1984年世界野生生物基金会的提议下促成的。雪豹和盘羊在国际上已列为濒危物种。除上面所提到的珍濒动物外，保护区内还有长尾早獭、草兔、棕熊、狠和狐狸分布。棕熊为国家二级保护动物。
　　鸟类中最多的是岩鸽，农区、高原牧场都广泛分布。在4500米以上高山棵岩和草丛地区，有两种雪鸽，在新疆地区唯此地有分布。
　　雪豹以栖息地高寒常年积客而得名。它身长约105一120厘米，足长90一100厘米，毛色通体灰白色，下身纯白，全身遍布黑色斑点和环纹，头部黑斑小而密，背部毛长约5厘米，腹部毛更长。雪豹属高山岩栖性动物，栖息在海拔2000一6000米的中高山上，生活在岩洞或岩石缝中。它是夜行动物，晨昏时最活跃。性凶猛机智，行动隐蔽而灵活，以北山羊、岩羊、盘羊、斑羚、麝等高原动物为食，也捕食锥类和啮齿类动物。冬末发情交配、妊期98一I05天，每产2—4仔，2—3岁性成熟，寿命18—20年。国内分布于青藏高原、甘肃、内蒙古等地。盘羊又名大头羊、八角羊。体长1.3—1．7米，肩高1米左右，体育浅灰棕色或暗棕色，胸、腹部黄棕色，臀部有白斑。雌雄均具角，雄角大而呈螺旋放曲，栖息丁海拔3000一5000米的高山寒漠无林带，也见于海拔 l000—3000米的荒漠地带，以禾草类、杂草、灌木小枝为食。群居3—5只或多至10只一群。每年10—12月发情交配，翌年4—5月产仔，每胎一仔。国内分布于西藏、新疆、甘肃、陕西、内蒙古、青海、四川等地。
　　岩羊体长1．3—1．4米，肩高O．7一O．9米，尾长13—14厘米，体重55—74千克。雌雄均有角，上体褐黄灰色，脸部深灰褐色或黑灰色。岩羊角高山动物，多栖息在2400一6000米高山裸岩或草甸带。群居10数只到百多只一起生活。晨昏出来觅食。冬末春初发情交配，妊期约 5个月，每胎1仔。国内分布于云南、贵介、四川、两藏、陕曲、甘肃、青海、内蒙古等地。

四、植物资源

　　保护区植物多为中山、业高山种类，以矮生、垫状或多绒毛为主要特征，组成高山漠摸、高山草甸等。高山荒摸以优若菠、麻黄、锦鸡儿，篙属植物为主。草句中以谷草占优势。在3600米以下才出现较高的灌木和乔木，有塔什库尔T杨、柳、伊犁、园拍、沙棘、蔷蔽等。

五、经营瞥理

　　保护区是根据新疆维吾尔自治区人民政府1984年批文建立的。
　　1．定界与区划 保护区内规划有绝对保护区及禁猎区。
　　2．机构与编制 保护区设立了塔什库尔干自然保护区管理站，编制10人。