道场。云门一系，自湛然（圆澄）以后，其势力颇足，与临济宗的天童一系相颉顽。时云门广孝寺、显圣寺法席大振，威震江南。清初，平水佛教进入高层次的理论研究，高僧、名僧层出不穷，湛然门下出石雨（明方）、三宜（明盂）、瑞白（明雪）。当时，继席云门显圣寺的均为有名宗匠，明方门下的远门净柱，位中净符，明盂门下的狼亭净挺、西遁净超，明雪门下的百愚净断等，都是很有名的禅宿、有语录行世。1586-1676年，临济宗禅宿高僧道忞，奉诏敕建平阳寺，建阁七楹，其血书法华经全部，堪称佛门珍品。清顺治十七年（1661），赐帑银五百两，重修云门寺塔。后毁。建国初，寺内尚存佛像，有宗教活动。辛亥革命后，平水佛教寺院每况愈下。抗日战争时，平水寺院遭日寇蹂躏，寺毁僧散。解放以后，又一些寺院被毁，云门寺年久失修，湮于榛莽之中。佛像被毁，寺屋改作他用。今尚存广孝寺部分殿宇 及碑文。1986年后，当地信教群众募款重建，重塑佛像，恢复宗教活动。寺内尚存明代“募修云门寺疏碑. 至目前，平水还保留云门寺的部分。
　　云门寺在历史上之规模是非常之宏大。云门寺鼎盛时期曾热闹非凡，陆游在《云门寿圣院记》中写到：“云门寺自晋唐以来名天下。父老言昔盛时，缭山并溪，楼塔重覆、依岩跨壑（hè）,金碧飞踊，居之者忘老，寓之者忘归。游观者累日乃遍，往往迷不得出。虽寺中人或旬月不得觌（dí ）也。”从此可以看出当年之盛况。另据《康熙会稽县志》中的记载和云门寺图上可以看出，进入峡谷之后首先看见的是一个写着“云门古刹”的石牌坊，然后是辩才塔、“卓立云门”石牌坊、雪峤塔、五云山亭、火者塔然后走过五云桥到达云门寺的山门前面，寺前面还有一片枫林，从图中我们可以看出云门寺当时的云门寺有五进之多，有山门、天王殿、大雄宝殿、法堂、禅堂等主要殿堂。寺院的两边各建有两排长长的厢房。寺院的周围还有铁门限、溪风阁墓、王子敬笔琢、王子敬山亭(书上说:唐高宗上元二年(675)三月上已日,名例“初唐四杰”之首的文学家王勃,在云门寺王子敬山亭主持过一次“克隆”晋代王羲之等人在兰亭曲水流觞的修禊盛事。)、洗砚池、白乳亭、五云山等。另外云门寺除主寺之外还设置有“看经院”（另有“刊经院”、之说）、“芍师院（忏堂）”、“显圣院”(云门显圣寺 寺址在今绍兴城区东南玉笥山前。后周显德二年（955），僧重曜于拯迷寺石壁峰前募缘建造。初名显圣院（云门看经院）。宋至道二年（996）九月，敕改显圣寺。院后有王子敬笔仓，实一眢井。元时，寺毁。明万历二十二年（1594），大学士张浚元等延请圆澄（湛然）禅师重建寺于玉笥山前，开法云门显圣寺，法席大盛。
　　全寺傍山而筑，占地面积1.33万平方米，建殿堂宇舍200余间。民国19年（1930），有僧200余人。32年，部分寺舍为侵华日军所焚。34年抗日战争胜利后，住持元相惨淡经营，然终难振旧观。1949年，有僧22名。1951年，寺舍废，改民居。)、广孝寺(广孝寺前，有宋高宗书“传忠广孝之寺”碑额，碑高丈余。寺有弥陀道场，杭僧元照书额。门外有丽句亭，刻唐贤诗赋于其上。寺前有辨才塔。寺内有辨才香阁，智永禅师之徒辨才曾居此。世传辨才于云门寺凿暗槛置右军兰亭序真迹于梁上，唐太宗御史萧翼以计取之。)、广福院（老宿所栖庵）、药师院等副寺，后来主寺日渐衰落各副寺就别立为寺了，如显圣寺、雍熙寺、寿圣寺等。在当时的这几个主要别立的寺院在加上云门寺本身被当地称为“一山四寺”、“一主四副”或云“一本而四名”。但在当地信众的观念中通常把这些寺院视其为云门一寺。另外在其不远还有很多的寺院、庵堂。“云门”只是一个总称而已。至宋，云门析为广孝、显圣、雍熙、普济、明觉、云门六寺。明万历《会稽志》卷十六载：“今云门有寺六：广孝，恩昱诸公所居也；上庵曰广福；看经院曰显圣；闷兴忏院早雍熙；西曰普济；南曰明觉，各有胜地。”足见当时的盛况
　　云门寺曾在中国佛教史上占有重要的地位。历任住持者皆系当时著名僧人，如首任住持帛道猷（yóu）系为东晋一代名僧。随后相继还有法旷、竺道一（壹）、支遁、昙一、弘明、弘瑜、智永、智果、圆信、湛然、重曜、净挺、辩才、允若、具德礼、王门等等皆是一代高僧，尤其是支遁和昙一，前者创“即色空”学说，后者创了“幻化宗”学说。对中国佛教的发展都产生过很大的影响，其中犹以辨才香阁最为文人喜爱。辨才为云门寺律师，王羲之七世孙智永之得意弟子，其生前所住香阁，当然亦为后人重视。香阁之得名，看来源于云门特有之天香。宋之问《宿云门寺》曰：“天香众壑满。”孙邈 《酬万八贺九云门下归溪中作》曰：“天香满袖归。”孟浩然《游云门寺诗》曰：“香界登阁憩。” 孙邈《宿云门寺阁》曰：“香阁东山下，烟花象外幽” 孙邈不住岩东院而住香阁院应从心理上考虑。（按宣宗大中年间，浙东观察史李褒到云门，也住香阁院，并留下《宿云门香阁院》诗）当年《兰亭序》就是藏在这香阁之梁槛之上，诗人宿此当为凭吊。另一处“客栈”当为东客院，即岩东院，云门寺接待院。当年萧翼受唐太宗之托来云门骗取《兰亭序》时便住于此。萧翼有《宿云门东客院》诗。诗人初至云门就是以此诗结交辨才，博得辨才好感。
　　历史上的云门寺与海外的佛教高僧也有着联系，如明末住持僧杉木祖师（原名段兰公）就曾去日本弘扬教义达三十年之久，为中日两国之间的佛教交流建立了良好的友谊基础。
　　云门寺在我国历史上曾经声名显赫，历代帝王都很启重此寺。如晋安帝、梁武帝、唐太宗、吴越王、宋太祖、宋太宗、宋高宗、清顺治、康熙、乾隆等皇帝都十分关注云门寺，或赐名题额、或树碑建塔、或给予各种赏赐等。
　　“十峰游罢古招提，路入云门峻似梯。秀气渐分秦望岭，寒声犹入若耶溪”。作为一处林泉秀美、环境清幽的寺庙丛林，云门寺尤其成为历代文人雅士山水游赏的对象。历代许多著名诗人、文人墨客和佛门高僧也都慕名而来寄居、访师游赏。至晋以后多有诗人扣访。如六朝宋时，谢康乐与从弟谢惠连人称大小谢，曾泛舟耶溪，对诗于王子敬山亭。“谢灵云与惠连联句，刻于（孤潭）树侧”（《嘉泰会稽志》卷十）。南朝诗人王籍虽只两首诗作留世，然亦有泛舟耶溪“蝉燥林愈静，鸟鸣山更幽”之千古绝句。梁代时，何胤曾 “居若耶山云门寺” （《嘉泰会稽志》卷十四）。僧洪偃曾驻足于此，写下一首有名的《云门寺》诗。六朝风流可见一般。唐朝诗人孟浩然、白居易、李白（李太白一生好入名山游，曾四到浙江，三上天台，在绍兴一带留有大量诗作，写及云门的就有“禹穴寻溪入，云门隔岭深”）。、杜甫（杜甫念念不忘少年越中之游，在给友人画中题诗时竟发出“貌得山僧似童子，若耶溪，云门寺，吾独胡为在泥滓，青鞋布袜从此始”的浩叹。）、杜牧、宋之问（初唐诗人宋之问更开越中唐诗风流之先河）。、崔颢、方干（千）、灵澈、严维、秦系、元稹（zhěn）、刘长卿、韦应物、萧翼、王勃（永淳元年（692年）初唐四杰之一的王勃率浙东诗人修锲于云门王子敬山亭，有《修锲云门献之山亭序》。王勃也许意犹未尽，于同年秋再次修锲于此，作有《越州秋日宴山亭序》，此后又有大历浙东唱和（57诗人））。、王维、贺知章、元微之、白天乐、梁萧等等，到了北宋云门依然为文人所重，宋代的文豪范仲淹、陆游、苏东坡、苏瞬钦、王安石等，南宋时更为一代诗宗陆游的少年读书处。陆游在多处诗中提及云门，撰有云门《寿圣院记》。辛弃疾曾任浙东刺史，从云门后登秦望山。写下《 》。 明代的开国军师刘基（刘伯温）（明代刘伯温曾在云门居住多日，留有大量诗作。《游云门记》《自云峰深居过普济清远楼记》、《发普济过明觉寺至深居记》、《深居精舍记》、《活水源记》便作于此）。、徐渭、陈洪绶（明亡后，陈洪授、祁豸佳等十人出家云门寺，结成十子社）。、董其昌、张元忭（明代状元张元忭缉有《云门志略》五卷。）、刘宗周等他们经美丽的若耶溪，来到这块佛坛和书坛的胜地，云门寺。《钱起、杜甫、孙逖、李褒、李弥逊、虞集、金涓、王思任等》并留下了不少相关赞美云门寺的不朽诗文、词句。云门寺僧特在寺前建立牌林，留下这些大诗人的佳作，名曰：“丽句亭”。如唐朝王勃写的《修禊（xì ）云门献之山亭序》、唐梁萧的《游云门寺诗序》、唐宋之问的《游云门寺》、宋邓牧的《自陶山游云门记》、宋陆游的《寿圣院记》、元允若辑之《云门集》、元虞集的《云门广孝寺记》、明刘基的《游云门记》、明陆梦龙的《云门寺记》等等。　云门寺唐时，便成为浙东唐诗之路的起点，杜甫的“若耶溪云门寺、青鞋布袜从此始”。就已成为千古绝唱。据初略统计《全