该工程是吐鲁番地区“十一五”规划重点建设项目，也是吐鲁番地委、行署努力建设“世界文化多样性（中国）综合示范区”的具体举措。新馆整体框架结构共3层，新馆建筑面积1万多平方米，文物展示面积为4000多平方米，比以前的老馆大了两三倍。曾经无处摆放、一直搁在仓库的珍贵文物这下有了重见天日、让参观者一睹“芳容”的机会。特殊的建筑造型、吐鲁番第一高观光塔、外墙巨型浮雕，这些都让新落成的博物馆成了吐鲁番地区别具特色的标志性建筑。

    据吐鲁番地区文物局局长、考古学博士李肖介绍，新馆的建筑、设计，包括装修、文物陈列展示的理念都是和国际接轨的。因为吐鲁番面对的不仅仅是疆内的游客和参观者，更多的是国内、乃至于国际游客和参观者，所以新馆筹建之初，就必须树立“世界眼光”。 吐鲁番地上、地下的文物众多，被称为世界天然的“露天博物馆”，至今仍有文物不断出土。这就为新馆不断更新所展出的文物提供了前提和条件，从而吸引更多的“回头客”，这在其他地方是很难做到的。在新馆中，有近一半文物是吐鲁番文物部门近几年新发掘出的从未展示过的文物，如2003年在鄯善县洋海墓地出土的萨满巫师干尸、彩绘泥塑武士俑等。

    除了保留以往出土文物的特色外，现代化展示是吐鲁番博物馆新馆的一大亮点。吐鲁番博物馆常务副馆长丁兰兰介绍说，新馆除了空间设计、设施、设备是国内一流外，还应用了声光电、微缩模型、场景模拟、幻影成像、多媒体查询触摸屏等现代展示技术。在馆内参观时还能看到以文物为主线拍摄的动画片和影视短片。这对于各年龄层次的旅客和参观者都具有很大的吸引力。

    新馆重新迎客后，将进行一段时间的试开放，之后将对公众免费开放。