（清华）信息科学与技术国家实验室（建设中）是2003年11月25日由国家科技部批准建设的第一批5个国家实验室之一。实验室以国家目标为引导，整合清华信息学科群的优势资源，集成了学校在信息领域的3个国家重点实验室（智能技术与系统国家重点实验室、微波与数字通信国家重点实验室、集成光电子学国家重点实验室）和两个教育部重点实验室（普适计算、生物信息学），实现了顶层统筹和资源集中。 实验室确定的战略性重点创新方向：海量智能信息处理理论、技术与应用，下一代互联网络的理论、技术与应用，新一代宽带无线与光通信理论与技术，新型微电子、光电子核心器件与技术等。
　　清科学与技术国家实验室（筹）积极建设优秀人才汇聚的团队，形成了一支专兼结合、固流结合、研教结合的高水平研究队伍，同时以讲席教授组的形式批量吸引国际一流人才参加国家实验室工作，目前已聘请计算理论与信息安全领域的姚期智讲席教授组、复杂网络化系统理论与技术领域的何毓琦讲席教授组、智能信息处理领域的黄煦涛讲席教授组。该实验室（筹）还注重建设高水平的开放合作平台，实现开放共享，充分体现了利用国家实验室框架在更大范围内进行资源整合的优势。
　　（清华）信息科学与技术国家实验室（筹）积极探索有利于国家实验室开展战略性、先导性科技创新的体制、机制改革，实行理事会指导下的主任负责制、与国际接轨的学术管理制度、以竞争和流动为核心的人事管理制度、科学合理的分配激励机制、岗位聘任制和任期合同制以及学术民主制，坚持“开放、流动、联合、竞争”的运行机制，努力促进学科的交叉和集成，促进学术交流和探索，促进人才的流动和汇聚，促进资源的开放与共享，营造有利于创新合作的文化氛围。该国家实验室（筹）还设有国际咨询委员会和学术委员会，积极与世界重要信息科技研究机构建立战略合作关系，开展合作创新和高水平学术交流，成为我国信息科技领域的重要国际交流窗口，并充分利用世界性的人才、技术、设备、信息、资金等优质创新资源，提升自主创新能力，开展高水平国际合作研究。近两年来，该实验室（筹）的国际合作项目有174项，经费超过1.8亿元。 在国家实验室（筹）的建设过程中，一批科研成果脱颖而出。在2005年度国家科学技术奖励大会上，数字电视技术研究中心首席科学家杨知行等完成的“时域同步正交频分复用数字传输技术(TDS-OFDM)”项目获国家技术发明奖二等奖；下一代互联网研究部吴建平教授等与清华紫光比威网络技术有限公司共同完成的“IPv6核心路由器”项目获国家科学技术进步奖二等奖。今年1月，“数字信息传输方法及其地面数字多媒体电视广播系统”和“一种本地无操作系统的网络计算机”分别获第九届中国专利金奖和优秀奖。