江西井冈山国家级自然保护区
　　6. 江西官山国家级自然保护区
　　7. 江西马头山国家级自然保护区
　　8.江西鄱阳湖国家级自然保护区
　　福建省（12个）
　　1. 福建厦门珍稀海洋物种国家级自然保护区
　　2. 福建将乐龙栖山国家级自然保护区
　　3. 福建天宝岩国家级自然保护区
　　4. 福建深沪湾海底古森林遗迹国家级自然保护区
　　5. 福建漳江口红树林国家级自然保护区
　　6. 福建虎伯寮国家级自然保护区
　　7. 福建武夷山国家级自然保护区
　　8. 福建梁野山国家级自然保护区
　　9. 福建梅花山国家级自然保护区
　　10. 福建戴云山国家级自然保护区
　　11. 福建闽江源国家级自然保护区
　　12. 福建君子峰国家级自然保护区

中国华中地区

　　河南省（11个）
　　1. 河南黄河湿地国家级自然保护区
　　2. 河南豫北黄河故道湿地鸟类国家级自然保护区
　　3. 河南焦作太行山猕猴国家级自然保护区
　　4. 河南南阳恐龙蛋化石群国家级自然保护区
　　5. 河南伏牛山国家级自然保护区
　　6. 河南宝天曼国家级自然保护区
　　7. 河南鸡公山国家级自然保护区
　　8. 河南董寨国家级自然保护区
　　9. 河南连康山国家级自然保护区
　　10. 河南小秦岭国家级自然保护区
　　11. 河南丹江湿地国家级自然保护区
　　湖北省（10个）
　　1. 湖北青龙山恐龙蛋化石群国家级自然保护区
　　2. 湖北神农架国家级自然保护区
　　3. 湖北五峰后河国家级自然保护区
　　4. 湖北石首麋鹿国家级自然保护区
　　5. 湖北长江天鹅洲白鱀豚国家级自然保护区
　　6. 湖北长江新螺段白鱀豚国家级自然保护区
　　7. 湖北星斗山国家级自然保护区
　　8. 湖北九宫山国家级自然保护区
　　9. 湖北七姊妹山国家级自然保护区
　　10. 湖北洪湖湿地国家级自然保护区
　　湖南省（15个）
　　1. 湖南炎陵桃源洞国家级自然保护区
　　2. 湖南东洞庭湖国家级自然保护区
　　3. 湖南壶瓶山国家级自然保护区
　　4. 湖南张家界大鲵国家级自然保护区
　　5. 湖南八大公山国家级自然保护区
　　6. 湖南莽山国家级自然保护区
　　7. 湖南永州都庞岭国家级自然保护区
　　8. 湖南小溪国家级自然保护区
　　9. 湖南黄桑国家级自然保护区
　　10. 湖南乌云界国家级自然保护区
　　11. 湖南鹰嘴界国家级自然保护区
　　12. 湖南南岳衡山国家级自然保护区
　　13. 湖南借母溪国家级自然保护区
　　14. 湖南阳明山国家级自然保护区
　　15. 湖南八面山国家级自然保护区

中国华南地区

　　广东省（11个）
　　1. 广东南岭国家级自然保护区
　　2. 广东车八岭国家级自然保护区
　　3. 广东丹霞山国家级自然保护区
　　4. 广东内伶仃岛－福田国家级自然保护区
　　5. 广东珠江口中华白海豚国家级自然保护区
　　6. 广东湛江红树林国家级自然保护区
　　7. 广东鼎湖山国家级自然保护区
　　8. 广东像头山国家级自然保护区
　　9. 广东惠东港口海龟国家级自然保护区
　　10. 广东徐闻珊瑚礁国家级自然保护区
　　11. 广东雷州珍稀水生动物国家级自然保护区
　　广西壮族自治区（15个）
　　1. 广西大明山国家级自然保护区
　　2. 广西花坪国家级自然保护区
　　3. 广西猫儿山国家级自然保护区
　　4. 广西山口红树林生态国家级自然保护区
　　5. 广西合浦营盘港—英罗港儒艮国家级自然保护区
　　6. 广西北仑河口国家级自然保护区
　　7. 广西防城金花茶国家级自然保护区
　　8. 广西十万大山国家级自然保护区
　　9. 广西弄岗国家级自然保护区
　　10. 广西大瑶山国家级自然保护区
　　11. 广西木论国家级自然保护区
　　12. 广西千家洞国家级自然保护区
　　13. 广西岑王老山国家级自然保护区
　　14. 广西九万山国家级自然保护区
　　15. 广西金钟山黑颈长尾雉国家级自然保护区
　　海南省（9个）
　　1. 海南三亚珊瑚礁国家级自然保护区
　　2. 海南东寨港国家级自然保护区
　　3. 海南铜鼓岭国家级自然保护区
　　4. 海南大洲岛海洋生态国家级自然保护区
　　5. 海南大田国家级自然保护区
　　6. 海南尖峰岭国家级自然保护区
　　7. 海南五指山国家级自然保护区
　　8. 海南坝王岭国家级自然保护区
　　9. 海南吊罗山国家级自然保护区

中国西南地区

　　重庆市（4个）
　　1. 重庆缙云山国家级自然保护区
　　2. 重庆大巴山国家级自然保护区
　　3. 长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
　　4. 重庆金佛山国家级自然保护区
　　四川省（22个）
　　1. 四川龙溪－虹口国家级自然保护区
　　2. 四川白水河国家级自然保护区
　　3. 四川攀枝花苏铁国家级自然保护区
　　4. 四川画稿溪国家级自然保护区
　　5. 四川王朗国家级自然保护区
　　6. 四川唐家河国家级自然保护区
　　7. 四川马边大风顶国家级自然保护区
　　8. 四川长宁竹海国家级自然保护区
　　9. 四川蜂桶寨国家级自然保护区
　　10. 四川卧龙国家级自然保护区（直属国家林业局；范围同四川省汶川卧龙特别行政区）
　　11. 四川九寨沟国家级自然保护区
　　12. 四川小金四姑娘山国家级自然保护区
　　13. 四川若尔盖湿地国家级自然保护区
　　14. 四川贡嘎山国家级自然保护区
　　15. 四川察青松多白唇鹿国家级自然保护区
　　16. 四川亚丁国家级自然保护区
　　17. 四川美姑大风顶国家级自然保护区
　　18. 长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区*
　　19. 四川米仓山国家级自然保护区
　　20. 四川雪宝顶国家级自然保护区
　　21. 四川花萼山国家级自然保护区
　　22. 四川海子山国家级自然保护区
　　贵州省（9个）
　　1. 贵州习水中亚热带常绿阔叶林国家级自然保